Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NLE1Q9NVX2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms