Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC4BQ9NT99 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4BQ9NT99 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms