Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG3Q9NT62 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG3Q9NT62 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms