Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC6A13Q9NSD5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC6A13Q9NSD5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms