Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX15Q9NRS6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNX15Q9NRS6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms