Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLE3Q9NRF9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms