Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC52A3Q9NQ40 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC52A3Q9NQ40 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms