Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGR6Q9HBX8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms