Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms