Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C20orf27Q9GZN8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C20orf27Q9GZN8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms