Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZC3H12CQ9C0D7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZC3H12CQ9C0D7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms