Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP1Q9C000 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP1Q9C000 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms