Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms