Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms