Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD1Q9BXT4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms