Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA3CQ99985 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms