Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITX2Q99697 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITX2Q99697 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms