Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRBNQ96SW2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms