Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIN3AQ96ST3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms