Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB3IPQ96QF0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms