Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MALSU1Q96EH3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms