Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NMD3Q96D46 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms