Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAF2Q96CS3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms