Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRG4Q92954 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRG4Q92954 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms