Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3BQ92485 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3BQ92485 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms