Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms