Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HJURPQ8NCD3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms