Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FSIP1Q8NA03 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms