Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms