Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CHCHD4Q8N4Q1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CHCHD4Q8N4Q1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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