Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLIP4Q8N3C7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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CLIP4Q8N3C7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CLIP4Q8N3C7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CLIP4Q8N3C7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLIP4Q8N3C7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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