Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJD3Q8N144 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms