Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms