Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIG3Q6UXM1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms