Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD54Q6NXT1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD54Q6NXT1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms