Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHEQ5VZ18 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SHEQ5VZ18 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms