Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRAMEF8Q5VWM4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRAMEF8Q5VWM4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms