Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms