Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM27BQ5VT28 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM27BQ5VT28 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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