Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LDLRAP1Q5SW96 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms