Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACER2Q5QJU3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.6 ms