Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC158Q5M9N0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms