Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNT1Q5JUK3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNT1Q5JUK3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms