Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C9orf116Q5BN46 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
C9orf116Q5BN46 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms