Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TDRD12Q587J7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms