Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACSM3Q53FZ2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms