Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUSP28Q4G0W2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUSP28Q4G0W2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms