Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms