Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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KRTAP27-1Q3LI81 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP27-1Q3LI81 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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KRTAP27-1Q3LI81 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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