Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CSPP1Q1MSJ5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms